Desain Ninja ZX-25R lagi-lagi juga nampak mirip dengan Ninja 250 2 silinder, tapi jika dicermati ada perbedaan signifikan. Misalnya bentuk bodi depan bawah lampu depan, Ninja ZX-25R punya winglet. Kemudian dari tampak muka, terdapat lubang ram air di atas lampu depan.

Ninja ZX-25R jadi motor sport 250 cc yang paling canggih untuk saat ini berkat sejumlah fitur yang diusungnya.

• Misalnya ada KQS (Kawasaki Quick Shifter) yang mempercepat perpindahan gigi tanpa harus menarik tuas kopling.
• KQS yang terpasang pada Ninja ZX-25R sendiri bukan cuma up shift saja, tapi juga down shift. Ini yang pertama di kelas sport 250 cc.
• Tapi ingat, fitur KQS hanya terpasang untuk varian Ninja ZX-25R ABS/SE saja ya, yang varian Standar enggak ada KQS.
• Kemudian ada Power Mode dengan 2 pilihan yakni Full dan Low. Pakai mode Full tentu tenaga dan respon mesin keluar 100%.
• Jika pakai mode Low, tenaga hanya keluar 65% saja, dan respon mesin jadi sedikit lambat.
• Kemudian ada KTRC (Kawasaki Traction Control), dengan 3 pilihan dan bisa disetel Off.
• Tentunya fitur-fitur tersebut juga sudah didukung oleh teknologi ride by wire, yakni proses membuka gas menggunakan kabel elektronik.
• Spidometer sendiri pakai paduan digital dan analog, dengan bentuk yang persis motor produksi terbaru Kawasaki.
• Pada mesin pun terdapat Assist & Slipper Clutch yang membuat tuas kopling terasa ringan, dan mengurangi efek ban mengunci saat down shift cepat.
• Kemudian untuk suspensi, depan sudah menggunakan tipe upside down dari Showa tipe SFF-BP (Separate Function Fork-Big Piston).